此外，深圳地铁12号线沿线大部分途经城市建成区，车站临近重要建（构）筑物63处，区间上跨、下穿及侧穿既有运营地铁线路3处，区间近距离下穿、侧穿建（构）筑物及重要管线25处，下穿海域、河流6处，线路存在软弱地层、基岩突起、球状风化岩等多变地质条件，施工安全风险高、施工效率低，且与在建线路存在大量接口，施工难度极大。
施工过程中，深圳地铁和中国电建始终发扬工匠精神，通过创新应用新技术、新设备，积累了盾构下穿海域破碎带的宝贵经验，并在双模盾构的施工实践中，创造了国内双模盾构洞内模式转换效率新记录。
截至目前，地铁12号线全线车站主体结构完成率达96%，139个附属结构已经开工建设，装饰装修、供电工程、通信工程、信号工程、消防工程等工作面已全面铺开。随着盾构区间的全线贯通，地铁12号线工程重心将全面转向站后工程。
